남성초등학교는 대한민국 국가교육과정과 국제교육과정을 두 가지 트랙으로 운영하여 학생들에게 교육 선택권을 보장합니다. 이를 통해 학생들은 국내 정규 초등학교 졸업과 함께 CIE(캠브리지 국제교육) 졸업 인증을 획득할 수 있습니다. 인증 테스트를 통해 전 세계 캠브리지 학교로 진학할 수 있으며, 국내학교와 국제학교 진학을 선택할 수 있는 기회를 제공합니다.

남성초등학교는 IB 국제교육과정을 통해 글로벌 인재를 양성합니다. 주요 교육 방식은 개념기반 탐구학습과 자기주도 학습으로, 학생들이 학습의 주인공이 되어 스스로 탐구하고 세상에 기여하는 상호작용을 통해 주도적인 교육을 실현합니다. 이를 통해 학생들은 인류 보편적 가치를 이해하고 국제적 소양을 갖춘 인재로 성장하도록 돕습니다.

남성초등학교는 영어를 일상화하여 학생들의 영어 능력을 향상시킵니다. 한국인 담임 선생님과 원어민 담임 선생님이 함께하는 2인 담임제로, 한국어와 영어를 일상적으로 사용합니다. 모든 교과목에서 원어민 선생님과 함께 수업을 진행하여 학생들의 영어 노출을 극대화하고, 영어를 자연스럽게 체득할 수 있는 환경을 제공합니다.

남성초등학교는 다양한 특색교육을 통해 학생들에게 풍부한 학습 경험을 제공합니다. 프로그램에는 1인 1악기, 1인 1운동, MARS, 창의수학 페스티벌, 오감체험활동, Together 활동, 예절수업, 자작자작 글쓰기, 사회기여활동 등이 포함됩니다. 또한, 스포츠클럽, 학생회, 지자체 연관 수업, 프로젝트 수업, 창의요리, 창의미술, 교육마술, 클레이, 무용, 치어리딩, 남성배구, 민화그리기 등 다양한 교과 운영을 통해 학생들이 즐겁고 흥미로운 학교 생활을 할 수 있도록 지원합니다.

남성초등학교는 전문적인 예술과 문화 생활의 경험을 제공합니다. 맞춤형 예술 과목을 통해 아이들의 재능을 발견하고, 문화예술인과의 협업 공연을 통해 수준 높은 문화와 공연을 경험할 수 있습니다.